Una vez sea completado el juego principal, aparecerá una serie de enemigos en Isla Craft. Combatirlos y vencerlos desbloquearé varios colores para Yoshi:
| Bronce | Derrota a los jefes del 1 al 4. |
| Oro | Derrota a los jefes del 5 al 8. |
| Plata | Derrota a los jefes del 9 al 12. |